土壤与水体
建筑物
本项目是北京大学工学院研究生课程《环境微生物学》的课程大作业,旨在探索燕园不同环境的微生物组成,绘制北京大学的微生物地图。
由于工学院的学科交叉背景,本课程选课同学只有少数具备微生物学背景,未来从事微生物学相关工作的比例更低。死板地进行课程考试或者专业报告对于多数同学而言毫无意义。
本项目力图通过微生物地图的绘制,使选课同学了解微生物基本知识的同时,可以发挥编程、计算等专业优势,在课程结束时能够留下看得见、摸得着的成绩,最终能够在本课程学习中有所“收获”。
当然,通过本项目的开展,也为科普和科学研究提供了探索之路。至少,点开地图能看到微生物分布,这个就很酷。
网址:mpku.top
#技术支持
地图绘制、数据可视化:高德地图
高通量测序数据分析:https://view.qiime2.org/(Nature Biotechnology 37: 852–857.)
网页框架:Bootstrap
特别感谢:ChatGPT的准保姆照料,让网页编程小白能够顺利完成网页制作(尽管一直debug)
项目负责:Dr. 聂勇(nieyong@pku.edu.cn)
建筑物采样:王思淇(sqwang1020@stu.pku.edu.cn)、陈彦(2301111755@stu.pku.edu.cn)、肖维(xiaowei@pku.edu.cn)
燕园北区采样:吴梦迪(mengdi_wu@stu.pku.edu.cn)、周孙鹏(2301111759@stu.pku.edu.cn)、张高歌(2301111752@stu.pku.edu.cn)
燕园南区采样:覃健梅(qinjm@pku.eu.cn)、曹洳铭(2301111754@stu.pku.edu.cn)、聂新崴(2301111760@stu.pku.edu.cn)
生物信息处理:王思淇、吴梦迪、曹洳铭、覃健梅
数据过渡处理:张高歌、陈彦、聂新崴
网页可视化:周孙鹏、肖维
技术支持:ChatGPT
如您发现错误,或者有任何问题和建议请联系
Dr. 聂勇(nieyong@pku.edu.cn)
我们也欢迎版本2.0,3.0,4.0...等经费和IT支持!
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